El Colegio es una Asociación Civil con participación federal mayoritaria que se rige por la Ley Federal de Entidades Paraestatales, y de acuerdo con la Ley de Ciencia y Tecnología de 2002 es un Centro Público de Investigación. Forma parte de la Red de Centros Públicos de Investigación SECIHTI, de ANUIES y de la Red de Colegios, y ha celebrado convenios con importantes instituciones internacionales.
